<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE article PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.3 20210610//EN" "JATS-journalpublishing1-3.dtd">
<article article-type="research-article" dtd-version="1.3" xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xml:lang="ru"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">vitj</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="ru">Врач и информационные технологии</journal-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Medical Doctor and Information Technologies</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn pub-type="ppub">1811-0193</issn><issn pub-type="epub">2413-5208</issn><publisher><publisher-name>Pirogov National Medical and Surgical Center</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="doi">10.25881/18110193_2026_3_90</article-id><article-id custom-type="elpub" pub-id-type="custom">vitj-410</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="heading"><subject>Research Article</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="ru"><subject>ОРИГИНАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="en"><subject>ORIGINAL RESEARCH</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title>Модифицированная модель глубокого обучения для бинарной сегментации почечных патологий</article-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>A modified deep learning model for binary segmentation of renal pathologies</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0009-0001-3159-8741</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Рудыко</surname><given-names>М. О.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Rudyko</surname><given-names>M. O.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="en"><p>Kursk</p></bio><email xlink:type="simple">tabeld@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0009-0003-7144-0775</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Яценко</surname><given-names>Е. В.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Yatsenko</surname><given-names>E. V.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Курск</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Kursk</p></bio><email xlink:type="simple">yatsenko1147@gmail.com</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0009-0008-8645-2847</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Макаров</surname><given-names>К. С.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Makarov</surname><given-names>K. S.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>к.т.н.</p><p>Курск</p></bio><bio xml:lang="en"><p>PhD</p><p>Kursk</p></bio><email xlink:type="simple">makarov_ks@kursksu.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff-1"><aff xml:lang="ru"><institution>ФГБОУ ВО «Курский государственный университет»</institution><country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en"><institution>Kursk State University</institution><country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><pub-date pub-type="collection"><year>2026</year></pub-date><pub-date pub-type="epub"><day>17</day><month>10</month><year>2026</year></pub-date><volume>0</volume><issue>3</issue><fpage>90</fpage><lpage>10</lpage><permissions><copyright-statement>Copyright &amp;#x00A9; Рудыко М.О., Яценко Е.В., Макаров К.С., 2026</copyright-statement><copyright-year>2026</copyright-year><copyright-holder xml:lang="ru">Рудыко М.О., Яценко Е.В., Макаров К.С.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="en">Rudyko M.O., Yatsenko E.V., Makarov K.S.</copyright-holder><license xml:lang="ru" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.</license-p></license><license xml:lang="en" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.</license-p></license></permissions><self-uri xlink:href="https://www.vit-j.ru/jour/article/view/410">https://www.vit-j.ru/jour/article/view/410</self-uri><abstract><p>Разработана модифицированная модель глубокого обучения для бинарной сегментации почечных патологий на компьютерной томографии. Актуальность исследования определяется потребностью в повышении точности и эффективности выявления аномалий на этапе первичной диагностики, особенно в условиях высокой нагрузки на медицинские учреждения.</p><p>Цель работы – создание универсальной системы автоматической детекции и локализации патологий почек без предварительной классификации их морфологического типа.</p><sec><title>Методы</title><p>Методы. В основе модели лежит модифицированная архитектура U-Net с пятью уровнями энкодера и декодера. Внесены изменения: замена максимального пулинга на свёртку с шагом два, использование групповой нормализа- ции и регуляризации методом исключений. Обучение проводилось на клиническом наборе данных из более чем 400 мультиспиральных компьютерных томографий с венозным контрастированием. Предварительная обработка включала преобразование интенсивностей в единицы Хаунсфилда, нормализацию без жёсткого ограничения диапазона и аугментацию данных. Для обучения применялась гибридная функция потерь, сочетающая коэффициент Дайса и бинарную кросс-энтропию.</p></sec><sec><title>Результаты</title><p>Результаты. На независимой тестовой выборке достигнуто значение средневзвешенного коэффициента Дайса 0,85. Модель демонстрирует высокую точность сегментации при различных типах патологий – кистах (включая сложные по классификации Bosniak), солидных опухолях и смешанных структурах. Сохраняется устойчивость при анатомических аномалиях (подковообразная почка, дистопия) и при малых размерах очагов (менее 5 мм).</p></sec><sec><title>Выводы</title><p>Выводы. Предложенная модель обеспечивает высокую универсальность и применимость в рутинной клинической практике. Возможность детекции широкого спектра патологий без предварительной типизации повышает её клиническую значимость и пригодность для скрининга.</p></sec><sec><title>Область применения</title><p>Область применения. Результаты могут быть использованы в онкоурологии для первичного анализа компьютерной томографии, подготовки к хирургическому вмешательству и обучения медицинских специалистов. Перспективна интеграция модели в системы хранения и передачи медицинских изображений для автоматической предобработки исследований.</p></sec></abstract><trans-abstract xml:lang="en"><p>A modified deep learning model for binary segmentation of renal pathologies in computed tomography (CT) scans has been developed. The relevance of this study stems from the need to improve the accuracy and efficiency of anomaly detection during primary diagnosis, particularly given the high workload faced by medical institutions.</p><p>The aim of the study is to create a universal system for the automatic detection and localization of renal pathologies without prior classification of their morphological type.</p><sec><title>Methods</title><p>Methods. The model is based on a modified U-Net architecture featuring five levels in both the encoder and decoder. Key modifications included replacing max pooling with strided convolutions (stride of two), implementing group normalization, and incorporating group normalization and dropout regularization. The model was trained on a clinical dataset comprising over 400 contrast-enhanced multidetector computed tomography (MDCT) scans. Preprocessing included conversion of intensities into Hounsfield units, range-free normalization, and data augmentation. A hybrid loss function combining the Dice coefficient and binary cross-entropy was used during training.</p></sec><sec><title>Results</title><p>Results. A weighted average Dice coefficient of 0.85 was achieved on an independent test set. The model demonstrates high segmentation accuracy across various types of pathologies, including cysts (including those classified as complex under the Bosniak system), solid tumors, and mixed structures. The model maintains robustness in the presence of anatomical anomalies (such as horseshoe kidney, renal ectopia) when dealing with small lesions (less than 5 mm in size).</p></sec><sec><title>Conclusions</title><p>Conclusions. The proposed model offers high versatilityand applicability in routine clinical practice. Its ability to detect a wide range of renal pathologies without prior classification enhances its clinical significance and suitability for screening purposes.</p></sec><sec><title>Application Area</title><p>Application Area. The results can be utilized in oncourology for initial CT scan analysis, surgical planning, and training of medical professionals. Integrating the model into medical image archiving and communication systems for the automated preprocessing of imaging studies holds significant promise.</p></sec></trans-abstract><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>Опухоль почек</kwd><kwd>почечно-клеточный рак</kwd><kwd>нейронная сеть</kwd><kwd>искусственный интеллект</kwd><kwd>машинное обучение</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="en"><kwd>Kidney tumor</kwd><kwd>renal cell carcinoma</kwd><kwd>neural network</kwd><kwd>artificial intelligence</kwd><kwd>machine learning</kwd></kwd-group><funding-group><funding-statement xml:lang="ru">При поддержке Федерального государственного бюджетного учреждения «Фонд содействия развитию малых форм предприятий в научно-технической сфере» в рамках программы «Студенческий стартап» федерального проекта «Платформа университетского технологического предпринимательства».</funding-statement></funding-group></article-meta></front><back><ref-list><title>References</title><ref id="cit1"><label>1</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Российское общество онкоурологов и др. Клинические рекомендации. Рак паренхимы почки. Министерство здравоохранения Российской Федерации. – Москва, 2023. Доступно по: omnidoctor.ru/upload/iblock/3f9/ucp3yrezax5ecu0d66dfuz1pvjl597yb.pdf. Дата обращения: 05.05.2024.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">РRossijskoe obshchestvo onkourologov i dr. Klinicheskie rekomendacii. Rak parenhimy pochki. Ministerstvo zdravoohraneniya Rossijskoj Federacii. Moskva, 2023. Available at: omnidoctor. ru/upload/iblock/3f9/ucp3yrezax5ecu0d66dfuz1pvjl597yb.pdf. Accessed 05.05.2024. (In Russ.)</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit2"><label>2</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Злокачественные новообразования в России в 2023 году (заболеваемость и смертность) / под ред. А.Д. Каприна и др. – М.: МНИОИ им. П.А. Герцена – филиал ФГБУ «НМИЦ радиологии» Минздрава России, 2024. – 276 с.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Zlokachestvennye novoobrazovaniya v Rossii v 2023 godu (zabolevaemost' i smertnost'). A.D. Kaprin i dr., editors. M.: MNIOI im. P.A. Gercena – filial FGBU «NMIC radiologii» Minzdrava Rossii, 2024. 276 s. (In Russ.)</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit3"><label>3</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">The 2023 Kidney and Kidney Tumor Segmentation Challenge (KiTS23). University of Minnesota Robotics Institute (MnRI); Helmholtz Imaging at DKFZ; Cleveland Clinic’s Urologic Cancer Program. 2023. Available at: kits-challenge.org/kits23. Accessed 15.05.2024.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">The 2023 Kidney and Kidney Tumor Segmentation Challenge (KiTS23). University of Minnesota Robotics Institute (MnRI); Helmholtz Imaging at DKFZ; Cleveland Clinic’s Urologic Cancer Program. 2023. Available at: kits-challenge.org/kits23. Accessed 15.05.2024.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit4"><label>4</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Hatamizadeh A, Tang Y, Nath V, Yang D, et al. UNETR: Transformers for 3D Medical Image Segmentation. Proceedings of the IEEE/CVF Winter Conference on Applications of Computer Vision (WACV). 2022: 574-584.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Hatamizadeh A, Tang Y, Nath V, Yang D, et al. UNETR: Transformers for 3D Medical Image Segmentation. Proceedings of the IEEE/CVF Winter Conference on Applications of Computer Vision (WACV). 2022: 574-584.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit5"><label>5</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Карпов О.Э., Субботин С.А., Шишканов Д.В. Использование медицинских данных для создания систем поддержки принятия врачебных решений // Системы поддержки принятия решений. – 2019. – №2. – С.16-23.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Karpov OE, Subbotin SA, SHishkanov DV. Ispol'zovanie medicinskih dannyh dlya sozdaniya sistem podderzhki prinyatiya vrachebnyh reshenij. Sistemy podderzhki prinyatiya reshenij. 2019; 2: 16-23. (In Russ.)</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit6"><label>6</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Постановление Правительства Российской Федерации от 11 декабря 2012 г. №1119 «Об утверждении Требований к защите персональных данных при обработке в информационных системах персональных данных» // Собрание законодательства Российской Федерации. – 2012. – №50. – Ст.7347.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Postanovlenie Pravitel'stva Rossijskoj Federacii ot 11 dekabrya 2012 g. №1119 «Ob utverzhdenii Trebovanij k zashchite personal'nyh dannyh pri obrabotke v informacionnyh sistemah personal'nyh dannyh». Sobranie zakonodatel'stva Rossijskoj Federacii. 2012; 50. St.7347. (In Russ.)</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit7"><label>7</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Постановление Правительства Российской Федерации от 21 марта 2012 г. №211 «О перечне мер, направленных на обеспечение выполнения обязанностей, предусмотренных Федеральным законом „О персональных данных“» (ред. от 06.09.2014) // Собрание законодательства Российской Федерации. – 2012. – №12. – Ст.1455.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Postanovlenie Pravitel'stva Rossijskoj Federacii ot 21 marta 2012 g. №211 «O perechne mer, napravlennyh na obespechenie vypolneniya obyazannostej, predusmotrennyh Federal'nym zakonom „O personal'nyh dannyh“» (red. ot 06.09.2014). Sobranie zakonodatel'stva Rossijskoj Federacii. 2012; 12. St. 1455. (In Russ.)</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit8"><label>8</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">ГОСТ Р 55036–2012. Информатизация здоровья. Псевдонимизация. Методы и рекомендации / ISO/TS 25237:2008. – Введ. 2013–07–01. – М.: Стандартинформ, 2012. – 16 с.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">GOST R 55036–2012. Informatizaciya zdorov'ya. Psevdonimizaciya. Metody i rekomendacii / ISO/TS 25237:2008. Vved. 2013–07–01. M.: Standartinform, 2012. 16 р. (In Russ.)</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit9"><label>9</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Федеральный закон от 27.07.2006 №152-ФЗ «О персональных данных» (с изм. и доп. от 08.08.2024) // Собрание законодательства Российской Федерации. – 2006. – №31. – Ст.3451.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Federal'nyj zakon ot 27.07.2006 № 152-FZ «O personal'nyh dannyh» (s izm. i dop. ot 08.08.2024). Sobranie zakonodatel'stva Rossijskoj Federacii. 2006; 31. St.3451. (In Russ.)</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit10"><label>10</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Медло А.А., Кобцова Т.В., Башкирова Л.В., Логовой Ю.Н. Методы диагностики и оценки степени распространенности онкологических заболеваний // Практическая онкология. – 2017. – Т.18. – №1. – С.322-329.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Medlo AA, Kobcova TV, Bashkirova LV, Logovoj YUN. Metody diagnostiki i ocenki stepeni rasprostranennosti onkologicheskih zabolevanij. Prakticheskaya onkologiya. 2017; 18(1): 322-329. (In Russ.)</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit11"><label>11</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Ronneberger O, Fischer P, Brox T. U-Net: Convolutional Networks for Biomedical Image Segmentation. Proceedings of the International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI). 2015: P.234-241.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Ronneberger O, Fischer P, Brox T. U-Net: Convolutional Networks for Biomedical Image Segmentation. Proceedings of the International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI). 2015: P.234-241.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit12"><label>12</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Srivastava N, Hinton G, Krizhevsky A, Sutskever I, Salakhutdinov R. Dropout: A Simple Way to Prevent Neural Networks from Overfitting. Journal of Machine Learning Research (JMLR). 2014; 15: 1929- 1958.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Srivastava N, Hinton G, Krizhevsky A, Sutskever I, Salakhutdinov R. Dropout: A Simple Way to Prevent Neural Networks from Overfitting. Journal of Machine Learning Research (JMLR). 2014; 15: 1929- 1958.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit13"><label>13</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Юрова А.С. Методы автоматизированной сегментации КТ-изображений брюшной полости: Дис. ... канд. физ.-мат. наук. – Москва, 2018. – 146 с.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">YUrova AS. Metody avtomatizirovannoj segmentacii KT-izobrazhenij bryushnoj polosti. [dissertation] Moskva, 2018. 146 h. (In Russ.)</mixed-citation></citation-alternatives></ref></ref-list><fn-group><fn fn-type="conflict"><p>The authors declare that there are no conflicts of interest present.</p></fn></fn-group></back></article>
